Vajinal mantar vajinada doğal olarak bulunan bir mantar nedeniyle oluşur. Candida albicans denilen bir mantar türü vajinal mantarın en sık sebebidir. Bazen birkaç başka tür Candida mantarı da vajinal mantardan sorumlu olabilir. Hiçbir vajinal mantar şikayeti olmayan kadınların %20-50’sinde Candida türleri bulunur. Bundan dolayı vajinal mantar şikayetlerinin ortaya çıkması için vajinada başka birtakım değişikliklerin olması gerekir. Bazı faktörlerin vajinal mantarı tetiklediği bilinmekte, bazılarının da vajinal mantarı tetiklediğinden şüphelenilmektedir.
Antibiyotik kullanan kadınların %30’unda vajinal mantar görülür. Her tür antibiyotik vajinal mantar olma riskinizi artırır ancak vajinal mantar olması için Candidanın zaten vajinada bulunması gerekir.